Drosophila pseudoobscura is een soort fruitvlieg die uitgebreid wordt gebruikt in laboratoriumonderzoek naar de genetica van natuurlijke populaties.
Het werd voor het eerst gebruikt door Theodosius Dobzhansky en zijn collega's. Zij verzamelden monsters van populaties in het westen van Noord-Amerika en Mexico, en lieten deze groeien in 'populatiekooien' in het laboratorium. Ze waren geïnteresseerd in natuurlijke selectie, genetische drift en andere aspecten van de populatiegenetica.
In 1989 gaf Diane Dodd laboratoriumpopulaties van D. pseudoobscura twee verschillende soorten voedsel, zetmeel en maltose. Ze evolueerden snel tot twee verschillende groepen na slechts acht generaties met de verschillende voedingsmiddelen. Omdat de twee groepen beide een sterke voorkeur toonden voor paring met hun eigen type, werd dit geclaimd als een voorbeeld van speciatie door voortplantingsisolatie. Dodd's experiment is herhaald door anderen, en werkt met andere soorten fruitvliegen en voedsel.
In 2005 was D. pseudoobscura de tweede Drosophila soort die zijn genoom liet sequencen, na Drosophila melanogaster.
