De Archamoeben zijn een belangrijke groep amoeben. Zij zijn ongewoon onder de protisten omdat zij geen mitochondriën hebben.
De groep omvat veel genera die inwendige parasieten of commensalen van dieren zijn: bijvoorbeeld Entamoeba en Endolimax. Sommige zijn ziekteverwekkers bij de mens en veroorzaken ziekten zoals amoebische dysenterie. Andere genera van archamoeben leven in zoetwater en hebben flagellen. De meeste hebben een enkele kern en flagellum, maar de reuzenamoebe Pelomyxa heeft er vele van elk.
Analyse van 100 genen toont aan dat de Archamoeben deel uitmaken van de Amoebozoa die hun mitochondriën hebben verloren. Zij zijn naaste verwanten van de slijmzwammen. Parasitaire en commensale vormen zoals Entamoeba en Endolimax hebben zich afzonderlijk van vrij levende voorouders ontwikkeld.