Trypanosoma is een geslacht van parasitaire protozoën. Er zijn in de klasse Kinetoplastida. Ze zijn een monofyletische groep van eencellige parasitaire flagellate protozoën. Alle trypanosomen hebben meer dan één bepaalde gastheer nodig om de levenscyclus te voltooien.
De meeste worden overgedragen door een vector, meestal door bloedvoedende ongewervelde dieren. Er zijn verschillende mechanismen tussen de verschillende soorten. In een ongewervelde gastheer zijn ze meestal te vinden in de darm, maar in hun zoogdiergastheer leven ze meestal in de bloedbaan of in de cellen.
Trypanosomen infecteren een verscheidenheid aan gastheren en veroorzaken verschillende ziekten, waaronder de dodelijke menselijke ziekten slaapziekte, veroorzaakt door Trypanosoma brucei, en de ziekte van Chagas, veroorzaakt door Trypanosoma cruzi.
Het mitochondriaal genoom van de Trypanosoma, en andere kinetoplastiden, bestaat uit een zeer complexe reeks cirkels en minicirkels. Het heeft veel eiwitten nodig voor de organisatie tijdens de celdeling.