Flora en fauna
De baai heeft het grootste bekende zeegrasveld ter wereld. Zeegrasvelden bevatten vele soorten van verschillende fyla. De herbivoor van zeegras is belangrijk in de voedselketen, en wordt gegeten door een aantal dieren, waarvan sommige zeldzaam zijn. Soorten die zich met zeegras voeden zijn onder meer groene schildpadden, doejongs, lamantijnen, vissen, ganzen, zee-egels en krabben. De mangrove moerassen in de ondiepe gebieden zijn ook vrij uitgestrekt.
Carbonaatproductie
De baai van Florida staat model voor de omstandigheden waaronder kalksteen ontstond op vele continentale plateaus in de wereld. Het is een soort carbonaat-'fabriek'. p144
In de baai van Florida is een soort bloeiende plant, zeegras genaamd, in overvloed aanwezig. Ook in overvloed is wit, melkachtig water vol calciumcarbonaat. Dit wordt hoofdzakelijk gevormd door Melobesia, een kleine rode alg die op het zeegras leeft. p151 Ook produceren de organismen enorme hoeveelheden slijm, dat een polysaccharide is. Er zijn goede redenen om aan te nemen dat het slijm door de algen wordt geproduceerd om de vorming van hun carbonaatskeletten te regelen. p139 Als neveneffect beperkt het slijm de hoeveelheid carbonaat die in het water in oplossing gaat, zodat het grootste deel ervan op de bodem terechtkomt. p155
Florida Bay is een vlak plateau dat een enorme hoeveelheid carbonaatgesteente heeft neergelegd.
"Je moet meer dan 3000 voet boren voor je bij een ander soort gesteente komt, en dat is van Krijt ouderdom - zo'n 70 miljoen jaar geleden". p158