Paus Johannes Paulus II prees Opus Dei en zei dat haar doel om God op de plaats van het werk te brengen iets groots is. Kardinaal Albino Luciani, die later PausJohannes Paulus I werd, zei dat Escriva een grote verandering teweegbracht in de manier waarop mensen met God omgaan. Voordien zagen de mensen het gebed als de enige manier om dicht bij God te zijn. Luciani zei dat Escriva ook belang hechtte aan werk. Het werk dat men doet kan gebed worden.
Maar toen Escriva dit begon te onderwijzen, begrepen sommige Jezuïeten in de jaren veertig hem niet. Zij zeiden dat zijn opvattingen in strijd waren met het katholieke geloof, omdat katholieken in die tijd dachten dat alleen priesters en nonnen heilig konden worden. Sommige Jezuïetenleiders begonnen te zeggen dat Opus Dei geheimen had waarvan zij niet wilden dat de wereld ze wist, en dat Opus Dei gevaarlijk was. In feite, zeiden zij, wilde Opus Dei alleen maar heel machtig worden en de wereld beheersen.
Al deze beschuldigingen werden opgehelderd door de pausen en katholieke functionarissen. Deze functionarissen zeggen dat Opus Dei iets goeds doet voor de wereld, door mensen te leren hoe zij goede gewoonten in praktijk kunnen brengen, zoals de waarheid vertellen, hard werken, beloften nakomen, mensen liefhebben en begaan zijn met hen die in nood verkeren.
Maar omdat de Jezuïeten zeer gerespecteerd zijn, geloofden veel mensen in de wereld wat zij zeiden. Opus Dei heeft veel kritiek gekregen van katholieken en niet-katholieken. Zij zeggen dat de leden een sterke drang ontwikkelen om invloed te verwerven, en dat het gedrag lijkt op dat van een sekte. Critici van Opus Dei zeggen ook dat er veel ongelijkheid is tussen mannen en vrouwen in de organisatie. Zij zeggen dat Opus Dei een zeer traditionele opvatting heeft over de rol van de vrouw in een christelijke samenleving. Volgens deze critici is het voor Opus Dei de plicht van de vrouw om zich bezig te houden met het huis en de kinderen van het gezin op te voeden.
In 2005 schreef een schrijver genaamd John L. Allen, Jr. een boek waarin hij deze beschuldigingen bestreed. Hij zei dat deze beweringen vooral gebaseerd zijn op het niet begrijpen van Opus Dei. Hij betoogde dat:
- Opus Dei onderwijst alleen wat de katholieke kerk onderwijst
- Er zijn veel Opus Dei vrouwen die zeer goede leiders zijn in zaken, mode, kunst, onderwijs, sociaal werk, en andere beroepen
- De helft van Opus Dei's leiders zijn vrouwen, en deze vrouwen leiden ook mannen
- Opus Dei leert dat vrouwen heel goed zijn in het zorgen voor hun gezin. Escriva zei dat vrouwen natuurlijke leraren zijn.
Een andere schrijver, Massimo Introvigne, zegt dat Opus Dei nu wordt aangevallen door mensen die niet in God geloven en mensen die vinden dat God niet aanwezig mag zijn in de wereld van de mensen. Deze mensen, zegt hij, willen niet dat religie terugkomt in het leven van veel mensen in de samenleving.