De Kiemtheorie van de ziekte is een theorie in de biologie. Het zegt dat kleine organismen (ook wel ziektekiemen genoemd), ook wel bekend als microben, ziekten veroorzaken. De meeste, maar niet alle ziekten zijn infectieziekten. De kiem-theorie stelt dat kleine organismen een reactie veroorzaken in het lichaam van degenen die besmet zijn. De reactie van het lichaam op een infectie wordt een ziekte genoemd.

Veel wetenschappers en artsen in de geschiedenis ontdekten dat ziekten worden veroorzaakt door microscopische organismen. Zelfs na de uitvinding van de microscoop wist men nog niet dat ziektekiemen ziekten veroorzaakten. Men geloofde lang dat "slechte lucht" van stinkende vuilnisbelten en van rottend vlees de oorzaak was van ziekten. De mensen dachten dus dat het bedekken van hun mond en neus met een doek zou helpen om de "slechte lucht" eruit te filteren. Wetenschappers en artsen zouden knoflook en parfums gebruiken om de slechte lucht af te weren. Maar mensen werden nog steeds ziek en stierven zelfs, dus deze theorie was verkeerd. Vervuilde lucht is niet de oorzaak van de ziekte.

Een probleem met de oude ziektetheorieën was dat mensen geloofden dat levende wezens spontaan werden gegenereerd. Spontane generatie is wanneer iets als een vlieg groeit uit een klein vlekje stinkend vlees. Die oude theorie heet abiogenese. In de zeventiende eeuw ontdekte Francesco Redi (18 februari 1626 - 1 maart 1697) dat vliegen eieren leggen die maden worden. Voordien dacht men dat maden afkomstig waren van rottend vlees. Hij ontdekte dit door wat vlees in een potje te verzegelen en te kijken. Er werden geen maden gevonden op het verzegelde vlees. Hij deed ook wat vlees in een pot en bedekte het met gaas. Er werden maden gevonden op het gaas, maar niet in de pot. Maar toen hij het vlees in een open pot deed, werden er maden gevonden op het vlees en in de pot. Experimenten als deze bewezen dat maden afkomstig zijn van vliegen die eieren leggen, niet van rottend vlees. Later zouden wetenschappers bewijzen dat ziekten niet uit de lucht komen. Ziekten worden verspreid door infectie.