Boodschapper RNA
De belangrijkste functie van RNA is om informatie van de aminozuursequentie van de genen te dragen naar de plaats waar eiwitten op ribosomen in het cytoplasma worden geassembleerd.
Dit wordt gedaan door boodschapper RNA (mRNA). Een enkele streng van het DNA is de blauwdruk voor het mRNA dat uit die streng wordt getranscribeerd. De volgorde van de basenparen wordt uit het DNA getranscribeerd door een enzym dat RNA polymerase heet. Vervolgens gaat het mRNA van de kern naar de ribosomen in het cytoplasma om eiwitten te vormen. Het mRNA vertaalt de volgorde van de basenparen in een opeenvolging van aminozuren om eiwitten te vormen. Dit proces wordt vertaling genoemd.
DNA verlaat de kern niet om verschillende redenen. DNA is een zeer lange molecule, en is gebonden aan eiwitten, histonen genaamd, in de chromosomen. mRNA, aan de andere kant is in staat om te bewegen en te reageren met verschillende celenzymen. Eenmaal getranscribeerd, verlaat het mRNA de kern en verhuist naar de ribosomen.
Twee soorten niet-coderende RNA's helpen bij de opbouw van eiwitten in de cel. Ze zijn transfer RNA (tRNA) en ribosomaal RNA (rRNA).
tRNA
Transfer RNA (tRNA) is een kort molecuul van ongeveer 80 nucleotiden dat een specifiek aminozuur draagt naar de polypeptideketen bij een ribosoom. Er is een verschillend tRNA voor elk aminozuur. Elk heeft een plaats waar het aminozuur zich kan hechten, en een anticodon dat overeenkomt met het codon op het mRNA. Bijvoorbeeld, codons UUU of UUC code voor het aminozuur fenylalanine.
rRNA
Ribosomaal RNA (rRNA) is de katalytische component van de ribosomen. Eukaryote ribosomen bevatten vier verschillende rRNA-moleculen: 18S, 5.8S, 28S en 5S rRNA. Drie van de rRNA-moleculen worden in de kern gesynthetiseerd, en één wordt elders gesynthetiseerd. In het cytoplasma vormen ribosomaal RNA en eiwit samen een nucleoproteïne die een ribosoom wordt genoemd. Het ribosoom bindt mRNA en voert de eiwitsynthese uit. Verschillende ribosomen kunnen op elk moment aan een enkel mRNA worden gebonden. rRNA is extreem overvloedig en maakt 80% uit van de 10 mg/ml RNA die in een typisch eukaryotisch cytoplasma wordt gevonden.
snRNA's
Kleine nucleaire RNA's (snRNA) verbinden zich met eiwitten om spliceosomen te vormen. De spliceosomen regelen alternatieve splicing. Genen coderen voor eiwitten in bits die exonen worden genoemd. De bits kunnen op verschillende manieren worden samengevoegd om verschillende mRNA's te maken. Zo kunnen uit één gen veel eiwitten worden gemaakt. Dit is het proces van alternatieve splicing. Eventuele ongewenste versies van het eiwit worden door proteasen versneden, en de chemische bits worden hergebruikt.