Keratine is het hoofdbestanddeel van de structuren die uit de huid groeien:
- de α-keratines in het haar (met inbegrip van wol), de hoorns, de nagels, de klauwen en de hoeven van zoogdieren
- de hardere β-keratines in de schubben en klauwen van reptielen, hun schelpen (chelonia, zoals schildpad, schildpad, moerasschildpad), en in de veren, snavels en klauwen van vogels. Deze keratinen worden hoofdzakelijk in betavellen gevormd. Beta-platen worden echter ook aangetroffen in α-keratines.
Geleedpotigen zoals schaaldieren hebben vaak delen van hun exoskelet die uit keratine bestaan, soms in combinatie met chitine.
Keratine wordt ook aangetroffen in het maag-darmkanaal van vele dieren, waaronder rondwormen (die ook een buitenlaag van keratine hebben).
Hoewel het nu moeilijk is om er zeker van te zijn, zouden de schubben, klauwen, sommige beschermende pantsers en de snavels van dinosaurussen vrijwel zeker uit een soort keratine zijn samengesteld.