The Lightning Thief
Perseus "Percy" Jackson wordt geïntroduceerd als een 12-jarige jongen met problemen. Hij heeft dyslexie, waardoor hij moeilijk kan lezen, en ADHD (Attention Deficit Hyperactivity Disorder), waardoor hij moeilijk kan opletten. Hij is van elke school afgetrapt waar hij heeft gezeten. Hij is net van Yancy Academy in Upstate New York getrapt. Hij heeft weinig vrienden op de school, zijn beste vriend is Grover Underwood, een satyr (half mens, half geit) vermomd als mens.
Tijdens een uitstapje naar een museum ergert Percy zich aan de pestkop van de school, Nancy Bobofit, omdat ze Grover heeft geïntimideerd. In een vlaag van woede roept hij per ongeluk water uit een nabijgelegen fontein om haar naar binnen te trekken, maar hij weet niet hoe hij dat gedaan heeft. Mevrouw Dodds, zijn lerares wiskunde, is getuige van het hele tafereel en zegt hem haar te volgen naar het museum voor een "gesprek". Plotseling verandert ze in de woedende Alecto, en valt hem aan, eruitziend als een vleermuisachtige figuur met enorme hoektanden. Percy slaagt erin haar te vernietigen met behulp van de pen van Mr. Brunner, Riptide, die in zijn hand in een zwaard verandert. Wanneer Percy echter terugkeert naar de bus en het aan zijn klasgenoten vraagt, herinnert niemand zich Mrs. Dodds door een kracht die bekend staat als de Mist. De enige die zich haar misschien herinnert is Grover, die altijd aarzelde voordat hij antwoord gaf. Alle anderen dachten dat haar naam Mrs. Kerr was.
Percy vraagt wat er zojuist gebeurd is, en Mr. Brunner zegt dat hij niets gezien heeft en dat Percy in het vervolg zijn eigen dingen moet meenemen om mee te schrijven. Percy vraagt zijn klasgenoten ernaar, maar die doen alsof er nooit een "Mrs. Dodds" is geweest. Percy ziet dat Grover liegt als hij aarzelt wanneer Percy het over "Mrs. Dodds" heeft. Percy hoort Grover en Mr. Brunner later in het schooljaar over hem praten. Als hij met Grover in de bus naar huis gaat, ziet hij drie oude vrouwtjes een reusachtige sok breien. Grover kijkt erg bezorgd naar hen. Percy laat Grover achter bij de bushalte en neemt in zijn eentje een taxi naar zijn appartement.
Zijn moeder arriveert kort nadat hij thuis is gekomen en vertelt hem dat ze het hele weekend naar Montauk Beach kunnen gaan. Percy is blij dat er eindelijk iets goeds is gebeurd en pakt zijn spullen en vertrekt. Op het strand wordt Percy midden in de nacht wakker van een storm en ziet tot zijn schrik dat Grover naar hem en zijn moeder toe komt en zegt dat ze moeten vertrekken. Percy is verward, maar zijn moeder neemt hen beiden mee in de auto en rijdt snel weg.
Nadat hij achter hen gegrom heeft gehoord, komt zijn moeder aan bij een heuvel en duwt beide jongens uit de auto. Percy ziet dat het ding dat hen achtervolgt een Minotaurus is, die hen aanvalt. Percy en zijn moeder ontwijken hem, maar Grover is te langzaam en de Minotaurus valt hem aan. Percy slaagt erin de Minotaurus te verslaan, maar niet voordat hij Percy's moeder in licht oplost en naar de Onderwereld stuurt. Percy sleept Grover de heuvel op naar Camp Half-Blood, waar Percy flauwvalt in de deuropening van het Grote Huis.
Percy leert dat Kamp Halfbloed een plaats is voor halfgoden zoals hij. Hij ontmoet een toekomstige vriendin, Annabeth Chase. Hij komt te weten dat Mr. Brunner eigenlijk de centaur (half mens, half paard) Chiron is, de activiteitenbegeleider van het kamp. Hij komt ook te weten dat de directeur van het kamp de god Dionysus is. Hij wordt voorgesteld aan Luke Castellan, de leider van de Hermes hut. Later, in een verover-de-vlag spel, verslaat Percy in zijn eentje Clarisse, leidster van de Ares hut, en drie anderen wanneer hij zijn verwondingen in water heeft genezen. Op dat moment komt hij erachter dat hij de zoon van Poseidon is en verschijnt er een holografische drietand boven zijn hoofd. Kort nadat hij ontdekt heeft dat de bliksemschicht van Zeus gestolen is, begint Percy zijn eerste en uiteindelijk succesvolle zoektocht, samen met Grover en Annabeth, om hem terug te vinden.
De Zee van Monsters
Thalia's boom, de magische grens van Kamp Halfbloed, is vergiftigd. Chiron krijgt de schuld van de vergiftiging en wordt uit het kamp ontslagen; Tantalus, die van de Velden van Straf komt en geen voedsel of water kan krijgen, neemt de taak op zich. Het enige dat de boom van zijn gif kan verlossen is het Gulden Vlies, dat zich bevindt op het eiland van Polyphemus (een andere zoon van Poseidon), in de Zee van Monsters (de Bermudadriehoek).
Clarisse, de dochter van Ares en oude vijand van Percy, krijgt de opdracht om naar de Zee van Monsters te gaan om het Gulden Vlies terug te brengen, dat genezende krachten heeft voor planten, dieren en mensen. Percy en Annabeth besluiten ook te gaan, niet alleen voor het Gulden Vlies, maar ook voor hun vriend Grover die gevangen zit in de grot van Polyphemus. Tyson, een jonge cycloop met wie Percy dat jaar op school bevriend is geraakt, vergezelt hen op hun reis. Tyson is de zoon van Poseidon en dus Percy's halfbroer.
Als ze de Zee van Monsters binnenvaren, moeten ze langs Scylla en Charybdis zien te komen. In plaats van te proberen tussen de twee in te varen, gaat Clarisse automatisch voor Charybdis en Tyson sterft vermoedelijk in Clarisse's schip nadat het gezonken is. Daarna reizen Percy en Annabeth naar vele gevaarlijke eilanden, en Annabeth vertelt Percy veel dingen over hoe Thalia is gestorven en ze heeft het ook over haar profetie en vertelt Percy dat hij een keuze moet maken als hij 16 jaar oud wordt. Terwijl ze zich een weg vechten door vele andere obstakels, zoals de Sirenen en Circe's eiland, komen ze samen met Clarisse, Grover, en later Tyson (die niet is gestorven), en vertrekken met het Gulden Vlies.
Als ze terugkeren naar de sterfelijke wereld, sturen ze Clarisse op een vliegtuig om alleen te kamperen, en Percy, Annabeth, Grover en Tyson worden ontvoerd door Luke. In een duel met hem wordt Percy bijna gedood. Hij wordt gered door Chiron, die onschuldig blijkt te zijn, en zijn familieleden, de Party Pony's. Wanneer ze terugkeren naar het kamp wordt het Vlies in de boom gelegd. Het Vlies doet niet alleen Thalia's boom herleven, maar ook Thalia. Het blijkt dat dit eigenlijk Kronos' plan was, zodat hij nog een kans zou krijgen om de profetie te controleren die de toekomst van Olympus en de Olympiërs regelt.
Aan het eind winnen Percy en Annabeth een wagenrace en geeft Annabeth Percy een kus op de wang.
De vloek van de Titaan
In het derde boek vindt Grover twee halfgoden op een school, Bianca en Nico di Angelo. Percy, Grover, Thalia en twee van Artemis' jagers, Zoë en Bianca (die er later voor kiest jager te worden, tot grote ontsteltenis van Nico), worden op een zoektocht gestuurd om Artemis te redden, die ontvoerd is. Percy gaat eigenlijk Annabeth redden, die gevangen is genomen terwijl ze de Di Angelo's aan het redden waren.
Tijdens de reis ontmoet Percy bij Hoover Dam een sterfelijk meisje, Rachel Elizabeth Dare genaamd, die door de Mist kan zien. Zij helpt hem ontsnappen aan skeletkrijgers die Percy en zijn vrienden probeerden aan te vallen.
Terwijl ze hen waarschuwt voor de schroothoop van de goden, vertelt Aphrodite, godin van de liefde, Percy dat er een romantische toekomst op hem wacht met Annabeth. Bianca wordt gedood door een gestoorde robot in de schroothoop van de goden, terwijl ze een beeldje voor haar broer Nico probeert te bemachtigen. Ze zei dat het het enige beeldje was dat hij nog miste in zijn verzameling. Tijdens de strijd met Atlas loopt Zoë dodelijke verwondingen op; ze wordt vergiftigd door haar oude vriend Ladon; haar vader, Atlas, maakt de genadeslag die haar doodt en Atlas heeft de last om de hemel weer vast te houden. Bij het betreden van Olympus beslissen de Goden of zij Thalia, Percy en Bessie (de ophiotaurus) zullen doden, die de beslissing in handen hebben om Olympus af te breken volgens de Grote Profetie. Thalia wordt een van Artemis' jagers, waardoor zij niet langer een potentiële ontvanger van de Grote Profetie is. Uiteindelijk besluiten de goden om Percy in leven te laten en de Ophiotaurus in veiligheid te brengen in de troonzaal. Daarna wordt er een feest gehouden ter ere van de helden en Athena vertelt Percy dat ze zijn vriendschap met haar dochter afkeurt. In het kamp vertelt Percy Nico over Bianca's dood; hij sprint het bos in. Vanaf dat moment haat Nico Percy en geeft hem de schuld van de dood van zijn zus. Annabeth, Percy en Grover zoeken naar Nico, maar kunnen hem niet vinden. Percy houdt dan het beeldje van de god vast dat Bianca hem gaf op de vuilnisbelt. Plotseling realiseert hij zich wie Nico's vader is: Hades, de heer van de doden.
De slag om het labyrint
In boek vier wordt het Labyrint van Daedalus ontdekt. Kamp Half-Blood dreigt via het Labyrint te worden binnengevallen door het leger van Kronos. Chiron stuurt Annabeth samen met Percy, Grover, en Tyson het Labyrint in op een zoektocht naar Daedalus. Ze hopen zijn kennis te kunnen gebruiken om aanvallen te verijdelen die via het reusachtige ondergrondse doolhof worden uitgevoerd. Uiteindelijk vinden zij Daedalus, die zich een nieuw lichaam heeft aangemeten en zich heeft vermomd als de zwaardvechter. Er volgt een gevecht, als Kronos' leger Kamp Halfbloed aanvalt door het Labyrint. Velen raken gewond en sommigen worden dood achtergelaten. Daedalus duikt op om te helpen, samen met zijn gigantische hellehond, Mevr. O'Leary. Daedalus is eeuwenlang aan de dood ontsnapt, maar geeft zich over aan Nico di Angelo, een zoon van Hades, zodat hij zijn straf in de Onderwereld kan aanvaarden en ook zodat hij zijn zoon Icarus en zijn neefje Perdix kan zien. Percy erft mevrouw O'Leary; zij zijn op elkaar gesteld geraakt. De relatie tussen Percy en Annabeth begint een nieuwe wending te krijgen. Annabeth redt Percy meerdere malen en kust hem een keer omdat ze denkt dat hij gaat sterven. Ze maakt ook een grote scène voor alle kampeerders als ze zich realiseert dat Percy nog leeft.
De laatste Olympiër
In boek vijf ontdekt Percy de waarheid achter de Grote Profetie. De kampeerders komen erachter dat er een spion onder hen is die alles doorvertelt aan Kronos, die in het vierde boek het lichaam van Luke heeft overgenomen. Percy vecht vele malen tegen Kronos, en wordt uiteindelijk onoverwinnelijk door te baden in de rivier de Styx.
In het begin worden Percy en Beckendorf, zoon van Hephaestus, op een zoektocht gestuurd om Luke's demonische cruiseschip op te blazen, en Beckendorf wordt gedood.
Percy en Nico sluipen het kamp uit, en ontmoeten Hestia, die Percy een deel van Luke's verleden laat zien, en ze ontmoeten Luke's moeder.
Er ontstaat een oorlog tussen de Titanen en de Olympiërs, een oorlog die al een groot deel van de serie in de maak is. Uiteindelijk doodt Luke, die ook onoverwinnelijk is geworden door het baden in de rivier de Styx, zichzelf om Kronos terug te sturen naar Tartarus. Silena Beuregard blijkt de spionne te zijn. Ze is een goed mens van binnen, maar Luke bedreigt haar, en ze maken een deal dat Beckendorf niet gekwetst zal worden, aangezien zij Beckendorfs vriendin was. Silena sterft bij een poging een drakon te doden, vermomd als Clarisse, wat Clarisse erg van streek maakt. Aan het eind van het boek pleegt Luke zelfmoord om de Olympiërs te redden.
Annabeth geeft toe dat ze nooit van Luke heeft gehouden, en dat ze alleen om hem gaf als om een broer. Zij en Percy verstevigen eindelijk hun relatie. Percy probeert haar te vertellen over zijn gevoelens bij de rivier de Styx, maar zegt dat ze het haar niet gemakkelijk maakt. Ze zegt: "Ik zal het je nooit of te nimmer gemakkelijk maken Zeewierbrein. Wen er maar aan", en kust hem dan, waarna de andere kampeerders hen in het kanomeer gooien. Percy creëert dan een luchtbel en ze delen "zowat de beste onderwaterzoen aller tijden.".