Zoöxanthellae
Sommige dinoflagellaten zijn zoöxanthellen: endosymbionten van mariene eukaryoten, en dieren zoals anthozoaire koralen. Deze rifbouwende koralen zijn er grotendeels van afhankelijk. Andere organismen die zooxanthellen kunnen huisvesten zijn kwallen, schelpdieren, foraminifera, zeeslakken (naaktslakken), en ook ciliaten en radiolaria.
Rode getijden
Dinoflagellaten zijn verantwoordelijk voor de "rode getijden" die vissen kunnen vergiftigen. Ze bloeien soms in concentraties van meer dan een miljoen cellen per milliliter. Sommige soorten produceren neurotoxines, die in dergelijke hoeveelheden vissen doden en zich ophopen in filtervoeders zoals schelpdieren, die ze op hun beurt kunnen doorgeven aan mensen die ze eten. Dit verschijnsel wordt rood getij genoemd, naar de kleur die de bloei aan het water geeft. Niet alle bloei van dinoflagellaten is gevaarlijk. Blauwachtige flikkeringen die 's nachts in het oceaanwater te zien zijn, zijn vaak het gevolg van de bloei van bioluminescente dinoflagellaten, die korte lichtflitsen uitzenden wanneer ze worden verstoord.
Classificatie
Hoewel geclassificeerd als eukaryoten, missen de kernen van dinoflagellaten enkele belangrijke kenmerken van eukaryotische kernen. In feite heeft Dodge de dinoflagellate kern mesokaryotisch genoemd, wegens zijn bezit van intermediaire kenmerken tussen de opgerolde DNA gebieden van prokaryote bacteriën en de goed gedefinieerde eukaryote kern. Deze groep bevat echter wel typisch eukaryote organellen, zoals golgi-complexen, mitochondriën en chloroplasten.
De groep bevat vele complexe organellen en levenswijzen. Sommige hebben structuren die lijken op de ogen van gewervelde dieren; sommige hebben nematocysten; sommige leven als plasmodia (multinucleate vormen); sommige hebben twee flagellen; fotosynthetische dinoflagellaten bevatten een "verbijsterende reeks" van plastidetypen; en hun hele genetica en celbiologie is excentriek.
Fossielen
Fossiele dinoflagellaten zijn belangrijk voor de stratigrafie, de datering en de correlatie van lagen. Tijdens hun leven hebben dinoflagellaten een beweeglijke planktonvorm en een resistente cystefase, waardoor ze in het sediment kunnen overwinteren. Alleen de cyste wordt gefossiliseerd. Hun eerste zekere verschijning is in het Siluur, met een grote uitstraling in het Mesozoïcum. p440 Ze worden door Margulis en collega's ingedeeld in het Phylum Dinomastigota.