De dinoflagellaten zijn een grote groep van flagellate protisten. Ongeveer de helft is fotosynthetisch, de rest zijn meestal heterotrofe predatoren van andere protisten. De fotosynthetische worden soms losjes "algen" genoemd; de predatoren worden soms losjes "protozoën" genoemd.

Zij zijn door verschillende auteurs ingedeeld in een orde, een klasse en een phylum. Er wordt actief onderzoek gedaan naar hun verwantschappen.

De meeste zijn marien plankton, maar ze komen ook voor in zoetwaterhabitats. Hun populaties zijn verspreid afhankelijk van temperatuur, zoutgehalte of diepte. De groep omvat vele symbionten en bioluminescente soorten.

Ongeveer 1.555 soorten vrijlevende mariene dinoflagellaten zijn momenteel beschreven. De laatste schattingen wijzen op een totaal van 2.294 levende dinoflagellatensoorten, waaronder mariene, zoetwater- en parasitaire dinoflagellaten.