Organisme
Een organisme is een individueel levend ding. Het is gemakkelijk om een levend ding te herkennen, maar niet zo gemakkelijk om het te definiëren. Dieren en planten zijn natuurlijk organismen. Organismen zijn een biotisch, of levend, deel van het milieu. Rotsen en zonneschijn maken deel uit van de niet-levende omgeving.
Organismen hebben meestal vijf basisbehoeften, om hun metabolisme voort te zetten. Ze hebben lucht, water, voedingsstoffen (voedsel), energie en een plek om te leven nodig. Maar niet alle levende wezens hebben dit alles tegelijkertijd nodig. Veel organismen hebben helemaal geen toegang tot lucht nodig.
Er moet een beetje nagedacht worden over virussen. Er is geen overeenstemming over de vraag of ze als levend moeten worden beschouwd. Ze zijn gemaakt van eiwitten en nucleïnezuur, en ze evolueren, wat een heel belangrijk gegeven is. Ze bestaan echter in twee heel verschillende fasen. De ene fase is slapend, niet actief. De andere bevindt zich in een levende cel van een ander organisme. Dan is het virus zeer actief en plant zich voort. Denk aan de parallel met een computerprogramma. Als het in gebruik is, is het actief; als het niet actief is, is het volledig inactief. Het is toch een programma.
Een ander voorbeeld uit de biologie is de spore, dat is een verspreidingsfase van een bacterie, schimmel of sommige planten. Ze zijn pas actief als ze in de juiste situatie zijn. Ze hebben alle werkende delen om een compleet organisme op te bouwen, maar op dit moment is het uitgeschakeld.
Sommige organismen bestaan uit miljoenen cellen. Het zijn meercellige organismen. Velen zijn te zien zonder gebruik te maken van een microscoop.
De meeste organismen zijn zo klein dat ze niet met het blote oog te zien zijn. Je hebt een microscoop nodig om ze te zien. Ze worden micro-organismen genoemd. Organismen kunnen uit slechts één cel bestaan. Ze worden eencellige organismen of eencellige organismen genoemd. Voorbeelden hiervan zijn bacteriën, en protozoën zoals de Amoebe en Paramecium.
Escherichia coli is een microscopisch klein eencellig organisme en ook een prokaryote.
Amoeben zijn ééncellige eukaryoten.
Polypore schimmels en angiosperm bomen zijn grote veelcellige eukaryoten.
Fylogenetische levensboom (Carl Woese). Virussen verschijnen hier niet omdat er geen bewijs is van hoe ze zich verhouden tot de andere drie koninkrijken van het leven
Oorsprong
Het Tree of Life project werkt aan de relaties tussen levende wezens. Het identificeren van een LUCA (laatste universele gemeenschappelijke voorouder) is een van de belangrijkste doelen. De LUCA heeft naar schatting zo'n 3,8 miljard jaar geleden geleefd (ergens in het Palaeo-archea-tijdperk).
Een universele gemeenschappelijke voorouder is minstens 102860 keer waarschijnlijker dan het hebben van meerdere voorouders.
Een model met een enkele gemeenschappelijke voorouder, maar met de mogelijkheid om genen te verwisselen tussen soorten was... 103489 keer waarschijnlijker dan het beste multi-ancestor model...
Het idee kwam van Charles Darwin's On the Origin of Species, "Daarom... waarschijnlijk zijn alle organische wezens die ooit op deze aarde hebben geleefd, afgedaald van één of andere primordiale vorm..."