De kern is het centrum van een atoom. Hij bestaat uit nucleonen, protonen en neutronen genaamd, en is omgeven door de elektronenwolk. De grootte (diameter) van de kern ligt tussen 1,6 fm (10−15 m) (voor een proton in lichtgewicht waterstof) en ongeveer 15 fm (voor de zwaarste atomen, zoals uranium). Deze maten zijn veel kleiner dan de grootte van het atoom zelf met een factor van ongeveer 23.000 (uranium) tot ongeveer 145.000 (waterstof). Hoewel het maar een heel klein deel van het atoom is, heeft de kern de meeste massa. Bijna alle massa in een atoom bestaat uit de protonen en neutronen in de kern. Slechts een kleine hoeveelheid massa is afkomstig van de ronddraaiende elektronen.

Neutronen hebben geen elektrische lading en protonen zijn positief geladen. Omdat de kern alleen uit protonen en neutronen bestaat, is hij positief geladen. Dingen met dezelfde lading stoten elkaar af: deze afstoting maakt deel uit van wat elektromagnetische kracht wordt genoemd. Tenzij er iets anders is dat de kern bij elkaar houdt, kan hij niet bestaan omdat de protonen elkaar dan zouden wegduwen. De kern wordt bij elkaar gehouden door een andere kracht, de sterke kernkracht.

Het woord nucleus stamt uit 1704 en betekent "kern van een noot". In 1844 gebruikte Michael Faraday nucleus om het "centrale punt van een atoom" te beschrijven. De moderne atomaire betekenis werd voorgesteld door Ernest Rutherford in 1912. Het gebruik van het woord nucleus in de atoomtheorie gebeurde echter niet onmiddellijk. Zo schreef Gilbert N. Lewis in 1916 in zijn beroemde artikel The Atom and the Molecule dat "het atoom bestaat uit de kern en een buitenste atoom of schil".