Cuttlebone
Inktvissen hebben een inwendig ruggengraat, gemaakt van calciumcarbonaat. Het is poreus, vol met kleine gaatjes, Het drijfvermogen van de zeekat kan veranderen, waardoor de zeekat lager of hoger kan komen door de hoeveelheid gas en vloeistof in de kamers te veranderen. Het rugschild van elke soort heeft een eigen vorm, grootte en patroon van ribbels of textuur. Inktvissen worden door juweliers en zilversmeden gebruikt als mallen voor het gieten van kleine voorwerpen. Vandaag zijn ze waarschijnlijk beter bekend als het materiaal dat aan gezelschapsvogels wordt gegeven als bron van calcium. Het rugschild komt alleen voor bij inktvissen, en is een van de kenmerken die hen onderscheidt van inktvissen en andere weekdieren.
Veranderende kleur
Inktvissen worden ook wel de kameleon van de zee genoemd omdat ze hun huid van kleur kunnen veranderen. Hun huid kan een kleurig patroon opflitsen om te communiceren met andere inktvissen en om hen te camoufleren voor roofdieren. Deze kleurverandering wordt veroorzaakt door groepen rood, geel, bruin en zwart gepigmenteerde chromatoforen boven een laag van reflecterende iridoforen en leucoforen. Deze zitten allemaal in de huid van de inktvis, en werken samen om de kleur te veranderen. Er zijn tot 200 van deze speciale pigmentcellen per vierkante millimeter.
De gepigmenteerde chromatoforen hebben een zakje met pigment en een groot membraan dat geplooid is wanneer het wordt teruggetrokken. Er zijn 6-20 kleine spiercellen aan de zijkanten die kunnen samentrekken om de elastische zak tot een schijf tegen de huid te pletten.
Iridoforen zijn plaatjes van chitine of proteïne, die licht kunnen weerkaatsen. Zij zijn verantwoordelijk voor de metaalachtige blauwe, groene, gouden en zilveren kleuren die vaak bij inktvissen te zien zijn. Al deze cellen kunnen in combinaties worden gebruikt. Inktvissen kunnen niet alleen de kleur van het licht beïnvloeden dat door hun huid wordt weerkaatst, maar ook de polarisatie van het licht, die kan worden gebruikt om signalen af te geven aan andere dieren die polarisatie waarnemen.
Ogen
De ogen van inktvissen behoren tot de meest ontwikkelde in het dierenrijk. De manier waarop de ogen van koppotigen zich ontwikkelen verschilt fundamenteel van die van gewervelde dieren zoals de mens, maar de manier waarop zij werken is vrij gelijkaardig. De gelijkenis tussen de ogen van koppotigen en die van gewervelde dieren is een voorbeeld van convergente evolutie. Hoewel zij geen kleur kunnen zien, kunnen zij de polarisatie van licht waarnemen, wat hun vermogen om contrast te zien verbetert. Zij hebben twee punten van geconcentreerde sensorcellen op hun netvlies (bekend als fovea), één om meer naar voren te kijken, en één om meer naar achteren te kijken. De lenzen worden niet zoals bij de mens in een andere vorm gebracht, maar door het gehele oog een andere vorm te geven om van scherpstelling te veranderen.
Bloed
Het bloed van een inktvis heeft een ongewone groen-blauwe kleur omdat het voor het vervoer van zuurstof gebruik maakt van het koperhoudende eiwit hemocyanine in plaats van het rode ijzerhoudende eiwit hemoglobine dat wordt aangetroffen bij gewervelde dieren. Dit is vergelijkbaar met het bloed van geleedpotigen. Hemocyanine is niet zo goed in het vervoeren van zuurstof als hemoglobine. Het bloed wordt gepompt door drie afzonderlijke "harten". Twee daarvan worden gebruikt om het bloed naar het kieuwenpaar van de inktvis te pompen (één hart voor elke kieuw), en het derde om het bloed door de rest van het lichaam te pompen.