SSRI's worden voornamelijk gebruikt om te behandelen:
Depressie
Antidepressiva zoals SSRI's zijn een eerste keus behandeling voor mensen met een zeer ernstige depressie. Wanneer iemands depressie niet zo erg is, maar counseling niet heeft geholpen, kunnen antidepressiva helpen.
Wetenschappers zijn het er niet over eens of SSRI's werken bij milde depressies die niet erg lang duren.
Angststoornissen
SSRI's werken goed bij gegeneraliseerde angststoornis. Ze helpen de angst van mensen te verminderen. Dit kan hen helpen deel te nemen aan counseling om te leren hoe ze met hun angst kunnen omgaan.
SSRI's werken ook goed bij obsessieve-compulsieve stoornis (OCD). Ze zijn de eerste keus behandeling voor mensen met zeer ernstige OCD. Net als bij depressie en gegeneraliseerde angststoornis zijn SSRI's geen genezing; mensen moeten ook deelnemen aan counseling en andere behandelingen. Mensen met OCD die een SSRI slikten, hebben echter ongeveer twee keer zoveel kans om het goed te doen in de behandeling dan mensen die geen SSRI slikten.
Fluoxetine (Prozac) en paroxetine (Paxil) zijn de enige medicijnen die door de Amerikaanse Food and Drug Administration zijn goedgekeurd voor de behandeling van posttraumatische stress-stoornis (PTSS). Medicijnen alleen genezen PTSS meestal niet; ze moeten worden gecombineerd met counseling. Met uitzondering van Prozac en Paxil, lijken de meeste andere SSRI's niet te helpen bij PTSS.
Eetstoornissen
Wanneer iemand in behandeling gaat voor boulimia nervosa of een eetbuistoornis, kunnen SSRI's een nuttige eerste stap zijn. Gedurende korte perioden kunnen ze enkele van de symptomen van deze eetstoornissen verminderen. Zo doen mensen die SSRI's nemen gedurende een korte periode minder aan eetbuien. SSRI's lijken echter slechts gedurende een korte periode te helpen.
SSRI's lijken niet te helpen bij anorexia nervosa. Als een persoon met anorexia echter ook depressie, angst of OCD heeft, zouden SSRI's kunnen helpen bij de behandeling van die problemen.
Chronische pijn
Uit onderzoek blijkt dat twee SSRI's kunnen helpen bij de behandeling van chronische pijn. Deze SSRI's zijn paroxetine (Paxil) en citalopram (Celexa). Andere SSRI's, zoals fluoxetine (Prozac), helpen niet bij chronische pijn.
Een andere groep antidepressiva, de zogenaamde tricyclische antidepressiva, behandelen chronische pijn beter dan SSRI's dat doen. Tricyclische antidepressiva hebben echter veel meer bijwerkingen dan SSRI's. Daarom schrijven sommige artsen bij chronische pijn paroxetine of citalopram voor, omdat de bijwerkingen dan minder erg zijn.