Jaren geleden probeerden Steppenwolf en zijn leger van Parademons de Aarde te veroveren en opnieuw te maken door de gecombineerde energieën van de Moederdozen voordat ze werden verijdeld door een verenigd leger van Amazones, Atlantiërs en mensen. Na het afweren van Steppenwolfs leger worden de Moederdozen gescheiden en verborgen op locaties over de hele wereld.
In het heden is de wereld in rouw na de dood van Superman. De angst van de mensheid voelend, keren Steppenwolf en zijn Parademons terug naar de aarde om hun jacht op de Moederdozen te hervatten door verschillende werknemers van S.T.A.R. Labs te ontvoeren, die in het bezit zijn van één doos. Na de ontvoeringen te hebben onderzocht en zelf een Parademon te hebben ontmoet, besluit Bruce Wayne verder te gaan met het rekruteren van zijn geplande team van metahumans omdat hij gelooft dat er een invasie op komst is.
Steppenwolf slaagt erin de Moederdoos uit Themyscira te halen, waardoor Koningin Hippolyta haar dochter Diana Prince waarschuwt. Diana sluit zich aan bij Wayne's groep en informeert hem over Steppenwolf en de Moederdozen. De twee slagen er niet in Arthur Curry en Victor Stone te overtuigen, maar slagen er wel in Barry Allen in het team te rekruteren. Stone sluit zich later bij de groep aan nadat zijn vader Silas is ontvoerd en Steppenwolf Atlantis aanvalt om de tweede Moederdoos te bemachtigen.
Het team ontvangt informatie van commissaris James Gordon dat de Parademons zich ondergronds verplaatsen, en concludeert dat Steppenwolfs leger is gestationeerd in een verlaten faciliteit. Hoewel de groep erin slaagt de ontvoerde werknemers te redden, loopt de faciliteit tijdens het gevecht onder water, waardoor het team vast komt te zitten totdat Curry hen redt, die besloten heeft zich bij hen aan te sluiten na Steppenwolfs aanval op Atlantis. Stone haalt de laatste Moederdoos uit S.T.A.R. Labs voor de groep om te analyseren. Wayne besluit de Moederdoos te gebruiken om Superman tot leven te wekken, niet alleen om hen te helpen het leger van Steppenwolf te bestrijden, maar ook om de hoop in de mensheid te herstellen. Diana en Curry aarzelen over het idee, maar Wayne vormt een geheim noodplan.
Het lichaam van Clark Kent wordt opgegraven en in het water van het Kryptonische schip gelegd, en Allen geeft een sterke energiestoot om de doos te activeren en Superman te doen herrijzen. Superman heeft echter weinig herinneringen, en hij valt de groep aan nadat Stone per ongeluk een projectiel op hem loslaat. Op het punt gedood te worden door Superman, voert Wayne zijn noodplan uit: Lois Lane. Superman kalmeert en vertrekt met Lois naar zijn ouderlijk huis, waar hij nadenkt en probeert zijn herinneringen terug te krijgen. Met de laatste Moederdoos onbewaakt, haalt Steppenwolf hem met gemak terug.
Zonder Superman om hen te helpen, reizen de resterende vijf helden naar een dorp in Rusland, waar Steppenwolf van plan is om de dozen opnieuw te verenigen en de wereld opnieuw vorm te geven voor zijn neef Darkseid. Het team vecht zich een weg door de Parademons om Steppenwolf te bereiken, maar kan hem niet genoeg afleiden zodat Stone de dozen kan scheiden. Superman arriveert en helpt Allen bij de evacuatie van de stad en Stone bij het scheiden van de Moederdozen. De verenigde helden slagen erin Steppenwolf te verslaan, die, overmand door angst, wordt aangevallen door zijn eigen Parademons, voordat ze allemaal worden meegenomen door een Boom Tube.
In de nasleep van de strijd besluit Wayne Wayne Manor te herbouwen als uitvalsbasis voor het team en hij en Diana komen overeen dat meer helden zich kunnen aansluiten. Diana begint zich als Wonder Woman meer met het publiek in te laten. Allen krijgt een baan bij de politie van Central City. Stone blijft zijn vaardigheden onderzoeken en verbeteren met zijn vader in S.T.A.R. Labs. Curry keert terug naar Atlantis. Clark keert terug als Daily Planet reporter en hervat zijn rol als Superman.
In een mid-credits scene besluiten Flash en Superman om te racen. In een post-credits scene is Lex Luthor ontsnapt uit de gevangenis en rekruteert premiejager Slade Wilson om hun eigen bond te vormen.